Zapalenie żołądka i jelit to stan, w których dochodzi do uszkodzenia nabłonka i błony śluzowej wyściełającego te narządy. Zmiany chorobowe polegają na powstawaniu nadżerek, ognisk martwicy, upośledzona jest regeneracja nabłonka, zniesione naturalne mechanizmy obronne błony śluzowej, mogą także być uszkodzone, przebiegające w jej obrębie włosowate naczynia krwionośne. Stan zapalny może mieć charakter ostry lub przewlekły.