Migdały wchodzą w skład układu odpornościowego organizmu, dlatego często są miejscem infekcji, chronią bowiem dalsze odcinki przewodu pokarmowego i dróg oddechowych przed czynnikami chorobotwórczymi. Pomimo że procesy zapalne w obrębie migdałków są częste i zazwyczaj niegroźne, to jednak w wielu przypadkach mogą rozwinąć się powikłania.